No presente relato de caso clínico, os autores informam sobre a complexidade de infecções bacterianas do sistema urinário de cães, tais quais aspectos da infecção multirresistente, informações do microbioma nesta espécie animal, o método ideal de coleta de material, as cultura-independentes, os casos de cistites recorrentes e as diretrizes sobre infecções do trato urinário e a resistência a terapias antimicrobianas. Relatam o emprego da ozonioterapia, como forma de tratamento em uma cadela da raça Beagle, após o fracasso com o uso de ciclos de antibioticoterapia, informando as vias de administração, o protocolo de tratamento e os exames clínicos obtidos com acompanhamento de dois anos e nove meses, e os resultado obtidos.